ファイルシステムの論理エラーと物理エラーを確認するコマンドです。
Windowsがおかしい場合は、このコマンドを走らせると修復できることがあります。
エラーメッセージがでていたり、ブルースクリーンが頻発するようなら、破損したWindowsシステムファイルをスキャンし修復できるsfcのコマンドがオススメです。
SFC（システムファイルチェッカーの略）は、Microsoft Windowsのツールで、実行ファイルはC:\Windows\System32フォルダにあります。
使用方法はコマンドを「管理者として実行」で
sfc /scannow
と打つと実行されます。